Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc24E9PUW8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc24E9PUW8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc24E9PUW8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc24E9PUW8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc24E9PUW8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms