Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prrt2E9PUL5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrt2E9PUL5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrt2E9PUL5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prrt2E9PUL5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prrt2E9PUL5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prrt2E9PUL5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms