Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Soga1E1U8D0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Soga1E1U8D0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Soga1E1U8D0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Soga1E1U8D0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Soga1E1U8D0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Soga1E1U8D0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Soga1E1U8D0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Soga1E1U8D0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Soga1E1U8D0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Soga1E1U8D0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Soga1E1U8D0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Soga1E1U8D0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Soga1E1U8D0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
Soga1E1U8D0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Soga1E1U8D0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
Soga1E1U8D0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Soga1E1U8D0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Soga1E1U8D0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Soga1E1U8D0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Soga1E1U8D0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Soga1E1U8D0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Soga1E1U8D0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Soga1E1U8D0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Soga1E1U8D0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Soga1E1U8D0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Soga1E1U8D0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Soga1E1U8D0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Soga1E1U8D0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Soga1E1U8D0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Soga1E1U8D0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Soga1E1U8D0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Soga1E1U8D0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Soga1E1U8D0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Soga1E1U8D0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms