Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rdh8D3Z6W3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh8D3Z6W3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh8D3Z6W3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rdh8D3Z6W3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh8D3Z6W3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms