Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp6ap1lD3Z5W0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp6ap1lD3Z5W0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp6ap1lD3Z5W0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp6ap1lD3Z5W0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms