Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
9630041A04RikD3Z3U4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
9630041A04RikD3Z3U4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
9630041A04RikD3Z3U4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
9630041A04RikD3Z3U4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
9630041A04RikD3Z3U4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
9630041A04RikD3Z3U4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms