Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm4871D3Z0W7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm4871D3Z0W7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm4871D3Z0W7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm4871D3Z0W7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm4871D3Z0W7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms