Protein–RNA interactions for Protein: B9EJU1

Gm1141, Gene model 1141, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1141B9EJU1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm1141B9EJU1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm1141B9EJU1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm1141B9EJU1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm1141B9EJU1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm1141B9EJU1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm1141B9EJU1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm1141B9EJU1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms