Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprbB2RU80 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprbB2RU80 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprbB2RU80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprbB2RU80 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprbB2RU80 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprbB2RU80 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PtprbB2RU80 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtprbB2RU80 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprbB2RU80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms