Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PtpruB1AUH1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PtpruB1AUH1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtpruB1AUH1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtpruB1AUH1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
PtpruB1AUH1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PtpruB1AUH1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PtpruB1AUH1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtpruB1AUH1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtpruB1AUH1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PtpruB1AUH1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PtpruB1AUH1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtpruB1AUH1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtpruB1AUH1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PtpruB1AUH1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtpruB1AUH1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PtpruB1AUH1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PtpruB1AUH1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms