Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Palm3A2TJV2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Palm3A2TJV2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Palm3A2TJV2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Palm3A2TJV2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Palm3A2TJV2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Palm3A2TJV2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Palm3A2TJV2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms