Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r232A2RTT5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r232A2RTT5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r232A2RTT5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r232A2RTT5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r232A2RTT5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms