Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pramef17A2ASJ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pramef17A2ASJ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pramef17A2ASJ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pramef17A2ASJ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pramef17A2ASJ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pramef17A2ASJ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Pramef17A2ASJ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pramef17A2ASJ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms