Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef25A2ASI9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef25A2ASI9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef25A2ASI9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pramef25A2ASI9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef25A2ASI9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pramef25A2ASI9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pramef25A2ASI9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms