Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtcflA2APF3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtcflA2APF3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtcflA2APF3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtcflA2APF3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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