Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lcn6A2AJB9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lcn6A2AJB9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms