Protein–RNA interactions for Protein: A2A825

Rsg1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsg1A2A825 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsg1A2A825 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsg1A2A825 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsg1A2A825 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsg1A2A825 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rsg1A2A825 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsg1A2A825 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsg1A2A825 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsg1A2A825 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rsg1A2A825 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rsg1A2A825 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsg1A2A825 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsg1A2A825 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms