Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cul4bA2A432 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cul4bA2A432 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cul4bA2A432 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cul4bA2A432 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cul4bA2A432 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cul4bA2A432 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul4bA2A432 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul4bA2A432 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul4bA2A432 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cul4bA2A432 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cul4bA2A432 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cul4bA2A432 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cul4bA2A432 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cul4bA2A432 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cul4bA2A432 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cul4bA2A432 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cul4bA2A432 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cul4bA2A432 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cul4bA2A432 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cul4bA2A432 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cul4bA2A432 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cul4bA2A432 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cul4bA2A432 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cul4bA2A432 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms