Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc173A0JLY1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc173A0JLY1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc173A0JLY1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc173A0JLY1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc173A0JLY1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc173A0JLY1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc173A0JLY1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc173A0JLY1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc173A0JLY1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc173A0JLY1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc173A0JLY1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc173A0JLY1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc173A0JLY1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc173A0JLY1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc173A0JLY1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms