Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YE38

4932443I19Rik, RIKEN cDNA 4932443I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932443I19RikA0A286YE38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4932443I19RikA0A286YE38 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4932443I19RikA0A286YE38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4932443I19RikA0A286YE38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4932443I19RikA0A286YE38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4932443I19RikA0A286YE38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4932443I19RikA0A286YE38 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.2 ms