Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GS82

A730009L09Rik, RIKEN cDNA A730009L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A730009L09RikA0A1B0GS82 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A730009L09RikA0A1B0GS82 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms