Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc194A0A140LIT1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc194A0A140LIT1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc194A0A140LIT1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc194A0A140LIT1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc194A0A140LIT1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc194A0A140LIT1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms