Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVR5

Rasgef1a, RasGEF domain family, member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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