Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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