Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sirpb1aA0A0A6YYP6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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