Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trbc2A0A075B5J4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trbc2A0A075B5J4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trbc2A0A075B5J4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trbc2A0A075B5J4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trbc2A0A075B5J4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbc2A0A075B5J4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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