Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl27Q99N92 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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