Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cnga1P29974 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms