Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpc1Q9QZF2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpc1Q9QZF2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms