Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MitfQ08874 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms