Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kdm5cP41230 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kdm5cP41230 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms