Protein–RNA interactions for Protein: P09793

Ctla4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla4P09793 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctla4P09793 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms