Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxb3P09026 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.4 ms