Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Efna3O08545 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna3O08545 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna3O08545 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms