Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfx7F8VPJ6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfx7F8VPJ6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms