Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PnckQ9QYK9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PnckQ9QYK9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms