Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gps1Q99LD4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms