Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nkx6-3Q3UHX8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nkx6-3Q3UHX8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx6-3Q3UHX8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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