Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm2aP59997 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm2aP59997 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm2aP59997 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm2aP59997 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm2aP59997 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm2aP59997 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm2aP59997 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm2aP59997 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm2aP59997 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kdm2aP59997 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm2aP59997 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm2aP59997 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm2aP59997 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm2aP59997 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm2aP59997 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms