Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Kif3aP28741 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms