Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RhoP15409 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RhoP15409 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RhoP15409 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms