Protein–RNA interactions for Protein: E9PZZ1

Prdm13, PR domain zinc finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm13E9PZZ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prdm13E9PZZ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prdm13E9PZZ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms