Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Subh2bvQ9D9Z7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Subh2bvQ9D9Z7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms