Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gps1Q99LD4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gps1Q99LD4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms