Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rassf9Q8K342 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms