Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MitfQ08874 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MitfQ08874 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms