Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mfsd4b4J3QNS5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mfsd4b4J3QNS5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms