Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brpf1B2RRD7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf1B2RRD7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms