Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc30Q8BVF4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc30Q8BVF4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms