Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q8BPC6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BPC6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms